机译:灵活的对接仿真:使用贝塞尔样条曲线的缩放集体变量蒙特卡洛最小化方法,以及与标准蒙特卡洛算法的比较
机译:MCDOCK:蒙特卡洛模拟方法,用于解决分子对接问题。
机译:MCDOCK:蒙特卡洛模拟方法,用于解决分子对接问题。
机译:基于网格计算的蒙特卡罗对接仿真方法用于计算手性识别
机译:从多元素同质和异质样品(立方样条)对X射线荧光光谱进行蒙特卡罗模拟。
机译:在对接模拟中达到全局最小值:使用贝塞尔曲线样条曲线的蒙特卡洛能量最小化方法
机译:通过使用适当选择的热力学循环和热力学积分方法进行蒙特卡罗计算机模拟,研究了将五种甲酰胺模型和三种水模型混合在一起时发生的热力学变化,包括这些模型组合本身的可混溶性。结果表明这两种组分的混合接近于理想的混合,因为混合的能量和熵在整个组成范围内都非常接近理想的项。关于混合的能量,甲酰胺的OPLS / AA-mod模型与其他模型相比,在质量上有不同的表现。因此,该模型得出的结果是负的,而其他模型则综合考虑了所有三个水模型的结果的正能量。实验数据支持后一种行为。尽管混合的亥姆霍兹自由能在整个组成范围内始终为负,但大多数测试模型组合显示出有限的混溶性,或至少非常接近某些组合物的混溶性极限。关于这些模型组合的可混溶性和混合能量,我们建议在水-甲酰胺混合物的模拟中使用CHARMM甲酰胺和TIP4P水模型的组合。